Le Synode est le parlement de l'Eglise et, à ce titre, l'organe législatif des Eglises réformées Berne-Jura-Soleure. Au niveau de son organisation, le Synode, qui compte 200 députées et députés, peut être comparé à un parlement cantonal. Il se réunit en général deux fois par année et décide entre autres de l'adoption du budget et des comptes annuels. Le Synode procède également à l'élection du Conseil synodal.