Les paroisses sont soumises à deux organes de surveillance : dans les cantons de Berne et de Soleure, la surveillance des affaires relevant d’ « aspects externes », tels que l’organisation ou le budget, est assurée par des services cantonaux, dans le canton du Jura par le Conseil d’Eglise, les Eglises réformées Berne-Jura-Soleure (Conseil synodal) étant responsables de la surveillance des affaires intérieures. En cas de conflit, le Conseil synodal peut aider à trouver des solutions appropriées.